Simon, garconnet autiste de neuf ans, mais un petit génie par son aptitude a résoudre les puzzles les plus complexes, décrypte fortuitement le code Mercury, mis au point par le lieutenant-colonel Kudrow de la NSA pour assurer la protection des agents infiltrés. L’ambitieux Kudrow, qui a misé sa réputation sur ce projet, est decidé à le sauver à n’importe quel prix. Après avoir liquidé les parents de Simon et les concepteurs du code, il n’hésitera pas a supprimer le garconnet. Art Jeffries, vétéran du FBI mis sur la touche, est chargé d’assurer la protection du gamin.